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基因型鑒定實(shí)驗(yàn)
更新時(shí)間：2025-07-24
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廠商性質(zhì)：其他
一、基因型鑒定實(shí)驗(yàn)技術(shù)定義與核心目標(biāo)
動(dòng)物基因型鑒定是通過(guò)分子生物學(xué)手段檢測(cè)個(gè)體特定基因位點(diǎn)的遺傳組成（如野生型、突變型、轉(zhuǎn)基因插入狀態(tài)），以確定其遺傳特征的技術(shù)。核心目標(biāo)包括：
確認(rèn)基因修飾類型：區(qū)分轉(zhuǎn)基因、基因敲除/敲入、點(diǎn)突變等模型。
鑒定遺傳狀態(tài)：判定純合子（-/-）、雜合子（+/-）或野生型（+/+）。
評(píng)估表達(dá)水平：驗(yàn)證目標(biāo)基因的轉(zhuǎn)錄或蛋白表達(dá)是否與預(yù)期一致。
生物學(xué)意義：為遺傳育種、疾病模型構(gòu)建及功能研究提供分子層面的精準(zhǔn)依據(jù)。
二、基因型鑒定實(shí)驗(yàn)核心鑒定方法及技術(shù)流程
1. PCR + 凝膠電泳（主流方法）
原理：針對(duì)目標(biāo)基因設(shè)計(jì)特異性引物，擴(kuò)增基因組DNA中的差異片段，通過(guò)電泳條帶大小判斷基因型（圖1）。
關(guān)鍵引物設(shè)計(jì)策略：模型類型 引物設(shè)計(jì) 檢測(cè)目標(biāo) 基因敲除（KO） 野生型引物：位于敲除序列內(nèi)；突變型引物：位于同源臂外或抗性基因內(nèi)（如Neo） 區(qū)分純合/雜合/野生 基因敲入（KI） 引物跨過(guò)插入位點(diǎn)，擴(kuò)增片段大小差異需>100bp 確認(rèn)外源序列整合位置 轉(zhuǎn)基因插入 引物結(jié)合外源基因（如GFP），需設(shè)置內(nèi)參引物（如β-actin） 檢測(cè)隨機(jī)插入是否存在 流程（以小鼠為例）：
瓊脂糖凝膠（1.5-2%）電泳，對(duì)比Marker判斷條帶大小（圖2）。
結(jié)果判讀：
野生型（+/+）：僅野生條帶（如500bp）。
雜合子（+/-）：野生+突變條帶（500bp + 700bp）。
純合子（-/-）：僅突變條帶（700bp）。
反應(yīng)體系：模板DNA + 特異性引物 + dNTPs + Taq酶。
程序：95℃變性→55-60℃退火→72℃延伸（30-35循環(huán)）。
DNA提取：剪尾/采血→蛋白酶K消化→酚氯仿抽提。
PCR擴(kuò)增：
電泳分析：
! PCR電泳結(jié)果示意圖（野生型、雜合子、純合子）
2. Southern Blot（金標(biāo)準(zhǔn)驗(yàn)證）
原理：基因組DNA酶切→電泳分離→轉(zhuǎn)膜→標(biāo)記探針雜交，檢測(cè)基因拷貝數(shù)及整合完整性。
適用場(chǎng)景：
驗(yàn)證轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)及是否重排/缺失（PCR無(wú)法檢測(cè)）。
鑒定隨機(jī)插入位點(diǎn)（需結(jié)合FISH技術(shù)）。
局限性：耗時(shí)長(zhǎng)（>3天）、需大量DNA（>10μg）、技術(shù)門檻高。
3. 實(shí)時(shí)定量PCR（RT-qPCR）
功能：
快速定量轉(zhuǎn)基因mRNA表達(dá)水平。
輔助判斷基因敲除效率（目標(biāo)基因表達(dá)量顯著降低）。
優(yōu)勢(shì)：靈敏度高、可自動(dòng)化。
4. 熒光原位雜交（FISH）
應(yīng)用：
直接觀察轉(zhuǎn)基因在染色體上的整合位置。
檢測(cè)染色體重排或局部缺失（如CRISPR脫靶效應(yīng)）。
三、基因編輯動(dòng)物模型的特殊鑒定策略
CRISPR/Cas9模型（如囊性纖維化豬）
細(xì)胞階段鑒定：
電轉(zhuǎn)遞送CRISPR組件至原代細(xì)胞→G418篩選陽(yáng)性克隆→PCR+Sanger測(cè)序驗(yàn)證編輯效率。
胚胎/個(gè)體鑒定：
核移植后電融合形成囊胚→移植至代孕母體→出生后剪尾PCR+測(cè)序。
關(guān)鍵指標(biāo)：目標(biāo)基因編輯效率、脫靶效應(yīng)檢測(cè)。
胚胎干細(xì)胞系構(gòu)建（如內(nèi)源標(biāo)簽融合）
流程：
電轉(zhuǎn)Cas9/sgRNA + 同源重組載體至干細(xì)胞（如Flip08細(xì)胞）。
藥物篩選（G418）→單克隆擴(kuò)增→PCR+測(cè)序驗(yàn)證標(biāo)簽整合位點(diǎn)。
